主基地的位置并非墨守成规，玩家可以根据自身进步战略的需要，对主基地的位置进行主动迁移。这一功能为游戏策略提供了极大的灵活性，允许玩家接近高价格资源区、和盟友会合或规避潜在威胁，是游戏中期以后重要的战略操作其中一个。

实现主基地的定给迁移需要满足多少明确的先决条件。首要条件是基地的指挥中心等级需要达到4级或以上，这是解开行政菜单中迁移功能的基础门槛。玩家必须在规划迁移的目标地点预先建造壹个独特建筑——前哨站指挥中心，而且需要将其更新至5级以激活资源对接功能。整个迁移流程还需要至少一艘处于空闲情形的工程船来执行建造和对接指令，如果全部工程船都在忙碌，迁移将无法启动。

玩家首先需要派遣工程船前往选定的目标坐标，部署前哨站并将其更新为5级的前哨站指挥中心。完成这一基建职业后，返回主基地界面，点击右下角的行政菜单，从中选择基地迁移选项。体系会识别并列出符合条件的可用前哨站，玩家确认目标坐标后，即可启动迁移。主基地的全部建筑和库存资源将被完整转移至新位置，原址则会被自动言败。

基地迁移功能存在一项决定因素的限制，即冷却时刻。每次成功迁移主基地后，该功能会进入一段长达240小时的冷却期，在此期间玩家无法再次发起迁移请求。这一设计标准玩家必须审慎规划每一次搬迁，综合思考资源分布、战略安全以及和盟友的协同布局，由于迁移后的位置将在未来不短的时刻内成为固定的运营中心。

除了这种主动、定给的迁移方法外，游戏内还存在一种被动的基地位置重置机制。当玩家的主基地在战争中防御失败并被彻底摧毁时，体系会自动在星系内的壹个随机安全坐标重构基地。这种方法虽然不需要满足前述的等级和前哨站条件，但具有不可控性，会导致一定的资源损失，通常不作为常规的迁移手段。